De 16-stappen sequencer is een kenmerkend deel van de TR-909. Er zijn zestien knoppen aan de onderkant van het apparaat die corresponderen met elke zestiende noot in een vierkwartsmaat. Wanneer bijvoorbeeld de knoppen 1, 5, 9, en 13 van een bass drum-klank worden ingedrukt, dan krijgt men een typisch patroon uit veel bekende muziek. Meerdere patronen kunnen gegroepeerd of gecombineerd worden, zodat er ook langere drumpatronen te maken zijn dan slechts een maat. In totaal kunnen er 96 patronen worden gecombineerd tot 896 maten. Wanneer de sequencer actief is, herhaalt zich een doorlopend licht van stap 1 naar stap 16.

De hihats zijn 6 bit-samples en bestaan uit een open of gesloten hihat, waarvan er maar een tegelijk kan worden afgespeeld. De cimbalen zijn ook 6 bit-samples en kan bestaan uit een ‘ride’ of ‘crash’.
Alle andere geluiden worden opgewekt vanuit een oscillator, met een filter en een ADSR-circuit. Hiervan kunnen bij de geluiden de pitch, attack en decay aan worden gepast.